Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms