Protein–RNA interactions for Protein: Q80VK6

Arhgef38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef38Q80VK6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef38Q80VK6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgef38Q80VK6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgef38Q80VK6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgef38Q80VK6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgef38Q80VK6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgef38Q80VK6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgef38Q80VK6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgef38Q80VK6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgef38Q80VK6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef38Q80VK6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef38Q80VK6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms