Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lamp3Q7TST5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms