Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms