Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms