Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms