Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Topbp1Q6ZQF0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms