Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms