Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms