Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms