Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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