Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms