Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhb9Q6PB60 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms