Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gapvd1Q6PAR5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms