Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms