Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms