Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms