Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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