Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms