Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrnp200Q6P4T2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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