Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RbfaQ6P3B9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RbfaQ6P3B9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms