Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms