Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms