Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms