Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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Pdzrn3Q69ZS0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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Pdzrn3Q69ZS0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Pdzrn3Q69ZS0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Pdzrn3Q69ZS0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Pdzrn3Q69ZS0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Pdzrn3Q69ZS0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Pdzrn3Q69ZS0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Pdzrn3Q69ZS0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Pdzrn3Q69ZS0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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