Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spty2d1Q68FG3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms