Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms