Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpgs2Q66JT5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms