Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Irf4Q64287 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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