Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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