Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms