Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms