Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aldh1a2Q62148 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aldh1a2Q62148 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms