Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms