Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtafrQ62035 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtafrQ62035 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtafrQ62035 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtafrQ62035 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtafrQ62035 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtafrQ62035 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtafrQ62035 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtafrQ62035 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtafrQ62035 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtafrQ62035 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtafrQ62035 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtafrQ62035 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms