Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hes3Q61657 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms