Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms