Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde3bQ61409 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde3bQ61409 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde3bQ61409 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde3bQ61409 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde3bQ61409 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde3bQ61409 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde3bQ61409 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde3bQ61409 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde3bQ61409 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde3bQ61409 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde3bQ61409 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde3bQ61409 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde3bQ61409 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde3bQ61409 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde3bQ61409 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde3bQ61409 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms