Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms