Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk2a1Q60737 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk2a1Q60737 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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