Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms