Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms