Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme4Q5SSW2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme4Q5SSW2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms