Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms