Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms