Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim58Q5NCC9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim58Q5NCC9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms