Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms