Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms