Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afap1l2Q5DTU0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms