Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf608Q56A10 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms